在定制木箱时，平衡设计与包装成本需要综合考虑多方面因素。从设计角度看，复杂的结构和个性化的设计虽然能满足特殊需求，但往往会增加成本。例如，特殊的榫卯结构制作工艺复杂，需要更多的人工和时间，会提高制作成本。因此，在设计时应根据货物的实际情况，避免过度设计。对于一些普通货物，采用简单实用的结构设计即可，如常见的钉接结构和常规的长方体形状，既能保证木箱的基本功能，又能降低成本。
在材料选择上，不同木材价格差异较大，如松木相对便宜，而红木等价格昂贵。应根据货物的价值和运输要求合理选择木材，不必一味追求高档木材。如果货物价值不高且对防潮、强度要求一般，选择价格较低的松木就能满足需求。同时，在保证质量的前提下，也可以考虑使用一些替代材料，如胶合板部分替代实木，以降低成本。
表面处理工艺也会影响成本。喷漆、涂漆成本相对较低，而打蜡、覆膜以及特殊表面处理成本较高。如果对木箱外观要求不是特别高，优先选择成本较低的表面处理方式。但如果是高档礼品包装等对外观要求高的情况，在预算允许的范围内选择合适的表面处理工艺。
此外，订单数量对成本也有影响。批量定制时，生产厂家可以通过规模效应降低单位成本，如批量采购原材料价格更优惠，生产流程也能更高效。所以在可能的情况下，尽量整合订单，增加单次定制数量，以获取更优惠的价格，实现设计与包装成本的良好平衡。
